Os executivos de tecnologia têm há muito elogiaram o potencial de seus modelos de IA para acelerar o ritmo das descobertas biológicas. Na semana passada, eles anunciaram um. Em um Anúncio de 23 de setembroa Anthropic afirmou que seu grande modelo de linguagem, Claude, havia identificado um sistema enzimático com propriedades “que lembram Crispr”, a ferramenta de edição genética ganhadora do Prêmio Nobel.
De acordo com a Anthropic, cerca de 950 agentes Claude correndo simultaneamente encontraram as sequências genéticas interessantes em 21,5 horas. “Parabenizo sinceramente a Anthropic por contar ao mundo sobre a sua descoberta”, afirma Fyodor Urnov, especialista em edição genética da Universidade da Califórnia, Berkeley, e diretor de I&D terapêutico do Innovative Genomics Institute. (IGI está colaborando com a Anthropic, mas não esteve envolvido na nova descoberta.)
Outros cientistas estão menos entusiasmados com a descoberta, que é a primeira de um grupo de pesquisa formado pela Anthropic no início deste ano. “Os experimentos ainda estão na fila. A RP já está ativa”, diz Le Cong, professor da Universidade de Stanford focado na integração da IA na pesquisa de engenharia genômica.
Antrópico, que possui montar um laboratório úmido para a descoberta de medicamentos, deixou claro que a descoberta não é o fim do seu trabalho. (“Ainda não entendemos o que este sistema faz”, disse a empresa em uma postagem X“mas apenas alguns sistemas conhecidos compartilham suas características, e todos eles são capazes de cortar, copiar e colar DNA.”) Um experimento físico foi incluído em um relatório técnicoque não foi revisado por pares. No entanto, muito mais precisa ser feito para determinar o significado desta descoberta. Ainda não se sabe se este sistema enzimático pode ser usado como uma ferramenta de edição genética e, em caso afirmativo, se é um útil ferramenta de edição genética.
“Digamos que estamos na praia de Santa Mônica e tentando vasculhar toda a areia para encontrar um diamante”, diz Cong. “A IA encontrou uma coisa que parece muito brilhante, e então você precisa voltar ao laboratório para saber: é vidro? É um diamante?”
Claude encontrou este objeto brilhante depois que pesquisadores da Anthropic a levaram a pesquisar em enormes bancos de dados genômicos por “novos exemplos interessantes” de transcriptases reversas, proteínas que copiam o RNA em DNA. Isto é o oposto do processo normal nas nossas células, no qual o ADN é transcrito em ARN, mas é utilizado por outros organismos numa variedade de funções biológicas, incluindo a inserção de segmentos de ADN.
Os agentes de Claude identificaram inicialmente mais de 200.000 possíveis transcriptases reversas, de acordo com a Anthropic, e, depois de escolher vários milhares que pareciam ser novos, estreitaram ainda mais o escopo, acabando por encontrar uma família “incomum” de transcriptase reversa contendo uma longa região de sequências repetidas de DNA que se assemelham ao Crispr. A Anthropic está chamando esse sistema de ART, abreviação de transcriptases reversas associadas a array. O sistema é encontrado em fagos jumbo, grandes vírus que infectam bactérias.
“Posso ver a olho nu uma matriz de repetição em tandem… é semelhante a um Crispr… matriz de repetição?!” um agente de IA escreveu. O agente também reconheceu que esse sistema poderia ser um retron, conforme consta no laudo técnico. Crispr e retrons são sistemas imunológicos bacterianos e, embora os retrons tenham alguma utilidade na edição de genes, eles não são a mesma ferramenta multifuncional que o Crispr é. Portanto, não é muito surpreendente que a postagem do blog da Anthropic tenha enfatizado a comparação com o Crispr.
Seth Shipman, investigador associado dos Institutos Gladstone, não acha que o que a Anthropic encontrou seja um novo sistema Crispr, mas diz que a descoberta ainda é interessante. “A novidade é como eles o encontraram, não o que é”, diz ele. Seu laboratório usou retrons para fazer sistemas de edição de genes, então é possível usar retrons dessa forma.
